想要PubMed的功力上升一个Level吗?来看看这些技巧吧
本期微课堂小编继续联手图书馆文献检索教研室,为大家介绍PubMed的智能匹配和MeSH检索。...
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本文由复旦大学图书馆文献检索教研室提供资料并给予指导,经复旦大学公共卫生学院研究生会整理发布。如需转载,请注明出处。
距离上次和同学们见面已经过去一周啦,本期微课堂小编继续联手图书馆文献检索教研室,为大家介绍PubMed的智能匹配和MeSH检索。小编相信,如果你能掌握并熟练运用这些技巧,检索PubMed的功力必定会上升一个Level哦!
1 概况
用了这么久的PubMed,但你知道PubMed究竟是如何诞生的吗?PubMed和MEDLINE之间又是什么关系呢?小编用一张图简单和大家介绍一下:
不少同学PubMed和MEDLINE傻傻分不清楚,其实简单来说,PubMed包含的文献不局限于MEDLINE,还包括其他一些未被MEDLINE收录的文献。
PubMed收录的文献有4种状态标记:①PubMed-as supplied by publisher;②PubMed-in process;③PubMed-indexed for MEDLINE;④PubMed。下面这张图显示了这4种状态标记之间的关系。(注:之前的OLDMEDLINE现已全部被转成 indexed for MEDLINE)
2 智能匹配
在讲智能匹配之前,小编要先给大家科普一个概念:MeSH。MeSH全称Medical Subject Headings,即医学主题词,是NLM编制的规范化主题词表,以它作为生物医学标引的依据以及建立MEDLINE数据库(只有被MEDLINE收录的文献才有MeSH词标引),在检索时,某些含义相近或不规范的用语都会被归为规范的MeSH词,因此用MeSH词检索可提高检索的准确性和全面性。
2.1智能匹配的优势
不知道同学们在检索PubMed的时候有没有发现,当直接在首页的检索框输入检索词并且不加任何限定,检索出的文献会很多,这就是PubMed智能匹配的结果。小编用“renal failure”(肾衰竭)给大家举个例子:
- 在检索框输入“renal failure”并且不加任何限制
- 检索结果页面右侧的“search details”显示:
2.2 智能匹配的缺陷
智能匹配虽然查得比较全,但有时也会查出一些相关度较低甚至根本不相关的文献。
- 比如小编输入“single nucleotide”(单核苷酸)
- 再看“search details”:
2.3 智能匹配的自动关闭
智能匹配并不总会进行,当输入的检索词含有截词符*,精确匹配符””,连字符-,或者字段限定符[ ],智能匹配就会自动关闭。
3 MeSH检索
为使检索更为精准,同学们可考虑使用MeSH检索。下面小编就带着大家一起操作。
3.1 MeSH检索的一般步骤
以“liver cancer”(肝癌)为例。
- 在基本检索框的PubMed下拉列表中选中“MeSH”→输入“liver cancer” →检索得多条结果→根据每条检索结果下方的解释,选择符合要求的条目点击进入(此处选择liver neoplasms)
- MeSH词下方显示副主题词(Subheadings),可按照检索要求与主题词搭配构建检索式→发送到“search builder” →完成检索
有时候根据以上步骤,直接输入检索词找不到对应的MeSH词,比如“tongue base cancer”(舌根癌),那怎么办呢?别方别方~小编教你用上级概念的MeSH词+自由词解决此类问题。
- 首先可在基本检索框中输入“tongue base cancer”,字段限定在篇名
- 在检索页面左侧找到“Show additional filters”→勾选“Journal categories” →点击“Show”
- 此时页面左侧已显示“journal categories”→勾选“MEDLINE” →页面刷新后显示的所有的结果均为MEDLINE标引好的文献。
MeSH检索虽然很强大,但最新的文献用MeSH词是检索不到的!!!因为标引MeSH词需要一定的时间,当最新的文献还处于“PubMed - as supplied by publisher”或者“PubMed – in process”的状态时,未标引MeSH词当然就检索不到啦。
所以若想查全最新文献,可在MeSH检索的基础上,在PubMed输入自由词进行检索,时间限定在近半年。(ps:所谓自由词是与规范的MeSH词相对而言的,可以认为是输入检索框的任意词)。例如:小编在此要特别提醒大家,自由词检索时应将尽可能将想到的同义词都放入检索式,如“cancer”“tumor”“carcinoma”“lymphoma”……,并且一定要记得将之前在MeSH检索选定的“Journal categories”的MEDLINE勾掉呀!!!不然搜来搜去还是在MEDLINE里面搜……
啰啰嗦嗦说了这么多,也许一时半会儿同学们未必都能记住,但是呢,小编想告诉大家,文献检索是一个不断练习,不断修正,不断提升的过程。同学们每次在检索框输入检索式后,当发现检索结果不理想时应主动查看“search details”,根据“search details”显示的内容,结合要检索的课题仔细分析,思考下一步应如何优化检索策略。在遇到不懂的问题时,除了请教身边的老师或者朋友,也可以多看看网站上的“help”,也许你要的答案就在这里哦~
PubMed很强大,但只有真正用好它,才能助我们的科研一臂之力。
上期回顾:
参考文献还在手动生成?这篇文章献给为论文奋斗的你!(点击即可查看)
下期预告:
PubMed有哪些易疏漏的匹配规则?
如何使用PubMed便捷的个性化设置?
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